實驗通量需求高而人工操作效率低?
三大核心優(yōu)勢,滿足您的高通量需求
01
Flex Stacker 耗材堆棧
一棧升級,5倍通量
模塊化設(shè)計的吸頭與微孔板存儲系統(tǒng),支持連續(xù)多板處理,無縫銜接高通量需求。
96 通道移液器
Flex 96 通道移液器支持整板移液操作,同時也支持單個或部分吸頭的拾取,適配多樣化實驗場景。
02
03
可自動密封的熱循環(huán)模塊
全自動PCR流程:集成Opentrons熱循環(huán)儀與自動密封蓋,支持多輪PCR反應(yīng)
實測數(shù)據(jù)說話
為了證明 Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站的有效性,我們成功實現(xiàn)了兩種常用 DNA 文庫制備試劑盒的自動化操作,通過兩種主流文庫制備方案(機械剪切法 vs 酶切片段化法)驗證了96樣本全自動化處理能力。
圖 1. 使用 IDT xGen MC Library Preparation Kit 和 Twist Library Preparation Enzymatic Fragmentation Kit 2.0,在 Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站上自動化處理 96 個樣本的文庫制備平臺布局
A 行:(A1) 搭載樣本板的 On-Deck PCR 模塊;(A2–A3) 吸頭盒;(A4) 配備吸頭盒的 Flex 耗材堆棧模塊
B 行:(B2) 廢液槽;(B3) 試劑板 2;(B4) 配備吸頭盒的 Flex 耗材堆棧模塊
C 行:(C1) 搭載試劑板 1 的溫控模塊;(C2) 試劑儲液槽;(C3) 板蓋;(C4) 擴展板位,放置最終樣本板
D 行:(D1) 吸頭盒;(D2) 純化板 1;(D3) 外置垃圾槽擴展模塊;(D4) 擴展板位,放置純化板 2
表1. MiSeq測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估結(jié)果
本表匯總了基于Illumina MiSeq平臺(2 × 150 測序模式)的測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估結(jié)果。檢測樣本包含采用IDT xGen MC 試劑盒制備的 Lambda 樣本和使用 Twist EF 2.0 試劑盒制備的人類基因組樣本。主要質(zhì)量指標包括:GC 含量、PF%(Percent Passing Filter)、Q30 值(Quality >30的百分比)及 比對率(Percent Mapped)。
圖 2. IDT xGen MC Library Preparation Kit
(A) 樣本板布局
(B) 文庫片段大小,使用 2% E-Gel 電泳檢測,配有 E-Gel DNA Ladder
(C) 文庫產(chǎn)量對比,F(xiàn)lex 自動化平臺與手動操作結(jié)果比較
圖 3. Twist Library Preparation Enzymatic Fragmentation Kit 2.0
(A) 樣本板布局,G 行與 H 行采用棋盤格(Checkerboard)模式進行測試
(B) 文庫片段大小,使用 2% E-Gel 電泳分析,配有 E-Gel DNA Ladder,展示典型的陽性與陰性樣本
(C) 文庫產(chǎn)量,對比陽性樣本與陰性對照產(chǎn)出結(jié)果
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