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Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站,釋放高通量 NGS 自動化的全部潛能

79次觀看 · 2025.04.29


實驗通量需求高而人工操作效率低?

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隨著精準醫(yī)療、癌癥研究與微生物組學等領(lǐng)域的飛速發(fā)展,高通量測序(NGS)需求激增,但傳統(tǒng)手動操作效率低、人力成本高,成為制約科研突破的瓶頸。如何在高通量、高重復(fù)的樣本處理中兼顧速度與精準?


Opentrons Flex高通量NGS工作站應(yīng)需而生——以全流程自動化重塑文庫制備,支持96樣本全無人值守處理,助您告別繁瑣,效率飆升!




三大核心優(yōu)勢,滿足您的高通量需求

01

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Flex Stacker 耗材堆棧

一棧升級,5倍通量

模塊化設(shè)計的吸頭與微孔板存儲系統(tǒng),支持連續(xù)多板處理,無縫銜接高通量需求。

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96 通道移液器

Flex 96 通道移液器支持整板移液操作,同時也支持單個或部分吸頭的拾取,適配多樣化實驗場景。

02

03

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可自動密封的熱循環(huán)模塊

全自動PCR流程:集成Opentrons熱循環(huán)儀與自動密封蓋,支持多輪PCR反應(yīng)




實測數(shù)據(jù)說話

為了證明 Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站的有效性,我們成功實現(xiàn)了兩種常用 DNA 文庫制備試劑盒的自動化操作,通過兩種主流文庫制備方案(機械剪切法 vs 酶切片段化法)驗證了96樣本全自動化處理能力。

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圖 1. 使用 IDT xGen MC Library Preparation Kit 和 Twist Library Preparation Enzymatic Fragmentation Kit 2.0,在 Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站上自動化處理 96 個樣本的文庫制備平臺布局

A 行:(A1) 搭載樣本板的 On-Deck PCR 模塊;(A2–A3) 吸頭盒;(A4) 配備吸頭盒的 Flex 耗材堆棧模塊

B 行:(B2) 廢液槽;(B3) 試劑板 2;(B4) 配備吸頭盒的 Flex 耗材堆棧模塊

C 行:(C1) 搭載試劑板 1 的溫控模塊;(C2) 試劑儲液槽;(C3) 板蓋;(C4) 擴展板位,放置最終樣本板

D 行:(D1) 吸頭盒;(D2) 純化板 1;(D3) 外置垃圾槽擴展模塊;(D4) 擴展板位,放置純化板 2


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表1. MiSeq測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估結(jié)果

本表匯總了基于Illumina MiSeq平臺(2 × 150 測序模式)的測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估結(jié)果。檢測樣本包含采用IDT xGen MC 試劑盒制備的 Lambda 樣本和使用 Twist EF 2.0 試劑盒制備的人類基因組樣本。主要質(zhì)量指標包括:GC 含量、PF%(Percent Passing Filter)、Q30 值(Quality >30的百分比)及 比對率(Percent Mapped)。


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圖 2. IDT xGen MC Library Preparation Kit

(A)  樣本板布局

(B)  文庫片段大小,使用 2% E-Gel 電泳檢測,配有 E-Gel DNA Ladder

(C)  文庫產(chǎn)量對比,F(xiàn)lex 自動化平臺與手動操作結(jié)果比較


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圖 3. Twist Library Preparation Enzymatic Fragmentation Kit 2.0

(A)  樣本板布局,G 行與 H 行采用棋盤格(Checkerboard)模式進行測試

(B)  文庫片段大小,使用 2% E-Gel 電泳分析,配有 E-Gel DNA Ladder,展示典型的陽性與陰性樣本

(C)  文庫產(chǎn)量,對比陽性樣本與陰性對照產(chǎn)出結(jié)果


結(jié)論

Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站兼容主流試劑盒,可自動化生成高產(chǎn)量、高一致性的測序文庫,助力科研效率飛躍。