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PCR技術(shù)應(yīng)用—遺傳病診斷

關(guān)鍵詞: pcr 技術(shù) 應(yīng)用 遺傳病來(lái)源: 互聯(lián)網(wǎng)

  傳統(tǒng)的基因診斷技術(shù)主要是以基因探針技術(shù)為基礎(chǔ)而建立的一些檢測(cè)方法,包括 Southerninnouthern印跡雜交,RFLP為,它們可直接分析基因的缺失和重排,亦可利 用RFLP時(shí)行連鎖分析,但由于這些技術(shù)操作繁瑣,探針來(lái)源困難所需設(shè)劑昂貴,且要 用同抗素.完成一項(xiàng)診斷需要的時(shí)間亦較長(zhǎng),因此難于滿(mǎn)足臨床診斷的要求.限制了它 在臨床上的應(yīng)用.PCR技術(shù)是一種在體外的海促DNA合成技術(shù),它能在短時(shí)間內(nèi)將靶DNA 擴(kuò)增百萬(wàn)倍,而且操用簡(jiǎn)便,省時(shí),準(zhǔn)確性也高,它不僅能直檢突變基因,而且可與 其它技術(shù)結(jié)合,使其診斷的準(zhǔn)確性幾達(dá)100%.而且不同同位素操作.能最大限度的滿(mǎn)足 臨床診斷的需要.因而它已成為目前遺傳病診斷的產(chǎn)前診斷的主要手段. 一、PCR技術(shù)診斷遺傳病的基本條件   PCR技術(shù)的基本原理是利用一對(duì)引物為介導(dǎo),在體外模擬天然DNA復(fù)制過(guò)程的技 術(shù),從生化的角度來(lái)看,它是一種海促反應(yīng),因此其反應(yīng)的過(guò)程中必須有酶的底物, 在這里酶為DNA聚合酶,沒(méi)酶是有耐熱性,底物為4種脫氯乙磷酸核菌酸.它所需要的 另一條件為引物,引物是根據(jù)已知的基因片段合成的一段20時(shí)左順的互解序列,因 此,要進(jìn)行PCR檢測(cè),除了具備酶,底物及其它基本因素外,利用已知的基因結(jié)構(gòu)合 成一對(duì)引物是PCR診斷遺傳病的最基本條件,也就是說(shuō),說(shuō)遺傳病的基因結(jié)構(gòu)必須部 分或全部清楚. 二、利用PCR技術(shù)診斷遺傳病的途徑 (一)PCR技術(shù)直接診斷遺傳病   對(duì)于由基因缺失突變引起的遺傳病可利用缺失區(qū)域還側(cè)的DNA序列引物直接擴(kuò)增 該區(qū)域,看有無(wú)特異性的擴(kuò)增產(chǎn)物,這對(duì)缺失部位固定的片段檢測(cè)非常準(zhǔn)確簡(jiǎn)便,只 需一對(duì)引物即可完成,而對(duì)于哪些缺失部位異質(zhì)的基因則可利用多對(duì)引物進(jìn)行多重 PCR,然后檢查缺失帶.對(duì)基因的重排來(lái)說(shuō),可通過(guò)用RT-PCR檢測(cè)mRNA的融合情況來(lái)檢 出,括入亦可用PCR方法來(lái)檢出,當(dāng)點(diǎn)突變影響到限制內(nèi)性切酶切點(diǎn)時(shí),可用PCR-RFL P進(jìn)行分析,即將擴(kuò)增產(chǎn)物用適當(dāng)?shù)膬?nèi)切酶切割,然后據(jù)電泳圖譜復(fù)制判斷有無(wú)內(nèi)切 酶切點(diǎn)的改變,它比傳統(tǒng)的RFLP檢測(cè)法快速簡(jiǎn)便,且不受同位素的危害.若突變優(yōu)點(diǎn) 及性質(zhì)已知.可用PCR-ASO,3’特異PCR及引物鐿爭(zhēng)法進(jìn)行確定,而對(duì)于突變優(yōu)點(diǎn)不清 楚或突變優(yōu)點(diǎn)多變的基因則可用PCR-SSCP,DGGE,CDGE,TGGE,PCR-RNSE切割,化簡(jiǎn) 錯(cuò)配切割,異源雙鏈分析長(zhǎng)久法進(jìn)行篩選與遺傳病有關(guān)的點(diǎn)突變,再用PCR循環(huán)直接 測(cè)序確定突變部位和性質(zhì). (二)利用連鎖分析間接診斷遺傳病   在有的遺傳病其基因結(jié)構(gòu)龐大,基因的分子病理改變復(fù)雜或不清楚,或異質(zhì)性較 高,利用PCR技術(shù)直接檢測(cè)與遺傳病有關(guān)的基因點(diǎn)突變有一定的困難.常常利用一些基 因內(nèi)或其旁側(cè)的一些多態(tài)性標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析,以間接判斷遺傳病,常以PCR方法進(jìn) 行檢測(cè)的多態(tài)性標(biāo)記有以下兩種.   1.PCR-RFLP   在人類(lèi)基因組中存在著許多限制性?xún)?nèi)切酶切點(diǎn),這些切點(diǎn)在人群中具有明顯的遺 傳變態(tài)性.因此可用已知DNA序列的基因內(nèi)或其旁側(cè)序列中的酶切位點(diǎn)多態(tài)性以PCR方 法來(lái)檢測(cè).PCR擴(kuò)增后用相應(yīng)的內(nèi)切酶進(jìn)行切割相應(yīng)的擴(kuò)增產(chǎn)物,通過(guò)用瓊脂糖蔌聚丙 烯胺凝膠電泳技術(shù)進(jìn)行電泳,分析酶切位點(diǎn)多態(tài)性,在家庭或黃間進(jìn)行連鎖分析.需 要注意的是,在用PCR-RFLP進(jìn)行連鎖分析時(shí)應(yīng)選擇那些雜合頻率多,即具有較高多態(tài) 信息量的酶切位點(diǎn)多態(tài)性.亦可采用多個(gè)多生酶切位點(diǎn)聯(lián)合應(yīng)用.   2.Amp-FLP   在人類(lèi)基因組中,除RFLP可作為遺傳標(biāo)記外還有一有用的多態(tài)性標(biāo)記,即VNTR(數(shù) 目可變的串聯(lián)重復(fù)序列,和STR(短的串聯(lián)重復(fù)序列).VNTR的特征是其重復(fù)的核心區(qū)內(nèi) 的串聯(lián)重復(fù)單位為6-40nt,重復(fù)次斷在不同個(gè)體有所不同重復(fù)次數(shù)變化亦較大,一般 在幾次到上每次之間.STR的核心重復(fù)單痊為2-5時(shí),其中由雙核苷酸重復(fù)(CA)n或(GT) n(n從10-60次)構(gòu)成的串聯(lián)重復(fù)稱(chēng)為VNDR.有意義的是,這些串聯(lián)重復(fù)序列在人群中具 有高度的遺傳多態(tài)性,人群中的雜合子比例在50%以上,最高的可達(dá)90%以上,因此它 仍可提供更多的多態(tài)信息量.VNTR和STR可用其兩端的序列合成引物,用PCR進(jìn)行擴(kuò) 增,PAGE+銀染堅(jiān)爾比即Amp-FLP,加之這些片段呈孟德?tīng)柣蜻z傳,因此用之作為連 鎖分析的標(biāo)記具有重要價(jià)值.目前Amp-FLP已廣泛應(yīng)用多種遺傳病的連鎖分析如DMD/B MD,DKU等.最近幾年的研究還發(fā)現(xiàn),已可是核苷酸重復(fù)的長(zhǎng)度變異可導(dǎo)致許多人類(lèi)疾 病.目前已證實(shí)的的與人類(lèi)疾病有關(guān)的致病性重復(fù)之聯(lián)核苷酸有脆性×染色體綜合征 (CGG)〉52,肌強(qiáng)直性營(yíng)養(yǎng)不良DM(CTG)〉50;×連鎖脊髓和延髓肌萎縮(CAG)HD(CAG)當(dāng). 利用串聯(lián)重復(fù)區(qū)所測(cè)序列合成的引物即可對(duì)這些遺傳病時(shí)行基因診斷.

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